MR-base:高效准确的进行孟德尔随机化研究的网站
生信修炼手册通过孟德尔随机化研究，可以基于GWAS的结果来推断不同表型之间的因果关系， 比如使用的很广泛的两样本MR分析
对于暴露因素X和结局变量Y两个表型，以遗传变量G为工具变量，通过各自对应的gwas结果来推断二者的因果关系。
目前gwas的公开结果很多，为了更加高效准确的进行MR分析，科学家们开发了MR-base数据库。该数据库收录了1600多个公开的GWAS结果以及基因，蛋白，代谢物，甲基化等不同水平的eQTL研究结果，同时开发了一个R包TwoSampleMR，并封装成了一个web app, 以方便科研人员，高效的利用这些公共数据集开展两样本的MR(简称2SM)分析, 对应的文章链接如下
/articles/34408
R包的源代码保存在github上, 链接如下
https://github.com/MRCIEU/TwoSampleMR
官网如下
/
通过官网的web app,可以方便的进行2SMR分析，整个过程分为了以下3步
1. choose exposures
选择暴露因素X对应的gwas结果，可以上传自己的gwas结果，也可以选择公共数据库。如果是自己上传结果，对格式有一定要求，必须有以下几列
SNP
effect allele
beta
se
官方的示例文件内容如下
2. choose outcomes
选择结局变量Y对应的gwas结果, 此时只能选择数据库中收录的gwas结果，示意如下
3. Run MR
运行2SMR分析, 调整参数之后，直接点击Perform MR analysis分析即可，结果示意如下
每一行代表一个不同的算法, nsnp代表模型中的SNP数量，b代笔beta, se代表标准误，pval表示p值。同时还提供了异质性和基因多效性偏倚的评估结果。当然也提供了很丰富的可视化结果，部分内容示意如下
如果想要更加灵活的进行分析，也可以直接使用TwoSampleMR这个R包，其使用手册网址如下
/TwoSampleMR/
具体用法后续在详细介绍。
·end·
肥胖=衰老！《肥胖》杂志文章称：肥胖可导致慢病早发，寿命缩短
《肥胖》杂志刊出文章指出，肥胖是一种加速衰老的疾病，应将肥胖视为一种衰老性疾病。作者称，肥胖和衰老是“一枚硬币的两面”。研究表明，40岁以后，肥胖使男性预期寿命缩短5.8岁，女性预期寿命缩短7.1岁。肥胖患者也有其他衰老迹象，包括“生命时钟”端粒的缩短、全身炎症和器官功能的衰退。作者指出，预期寿命的缩短可能是因为肥胖在多个层面上加速了衰老。
杨进刚阜外2023-09-02 16:56:260000中美研究显示，雾霾对智力影响相当于让人少上一年学
生活在起起落落的雾霾中，有没有觉得自己变迟钝？近期一项中美学者进行的研究表明，长期“徜徉”在浓浓的雾霾中会让人变得愚钝，受损程度相当于白念一年书。研究显示，受试者的语言能力和计算能力都会受到长期空气污染的影响。这种空气污染对大脑老化的作用，会随着增龄而影响更为明显，并且对男性和受教育程度较低的人群影响尤其显著。中国最大规模房颤调查公布：10年房颤患病率增20倍，相关卒中增13倍
解放军总医院王玉堂等近期一项研究发现，从2001年~2012年，我国年龄≥20岁居民房颤患病率大幅上涨，由2001年的0.01%升至0.2%，10年间升高了20倍。研究还发现，房颤相关卒中10年升高了13倍，房颤相关卒中由2001年的0.01%增加至1.3%，该研究使用了一个我国西南地区的1千万人的医保数据库，最终纳入471446名居民，1237例房颤患者，其中新发921例房颤。杨进刚阜外2023-07-28 11:46:400000中国加大戒烟宣传，但烟草销售额仍在上升！重庆学者柳叶刀通讯文章
近期，重庆学者在柳叶刀杂志发表通讯文章指出，中国于2005年加入了世界卫生组织烟草控制框架公约之后，近十年来，我国政府加强了媒体对禁烟的宣传，并制定相关政策加强了禁烟管理。但矛盾的是，烟草销售额一直在上升。烟草销售对我国经济至关重要。2018年，全国烟草工业总产值1万亿元，同比增长3.37%；工业增加值7877亿元，同比增长4.88%。哈佛大学研究：防止老年变傻，要多吃绿叶和深色蔬菜！
11月21日，国际知名期刊Neurology杂志发表的一项研究表明，多吃蔬菜（主要是绿叶蔬菜、橙色和红色蔬菜）、水果（主要是浆果类水果）以及多喝橙汁可能有助预防记忆丧失。这项研究由美国哈佛大学陈曾熙公共卫生学院研究者开展，纳入了约2.8万名平均年龄51岁的男性卫生专业人士，一共随访20年。受试者每4年接受食物问卷调查以及思考和记忆能力主观问卷测试。
